4. série
04x01,02 Cesta válečníka I. a II. část
Na stanici znenadání přilétá velká flotila klingonských lodí pod velením generála Martoka. Stanice je zaplavena davy nerudných a popudlivých Klingonů. Ve vzduchu visí napětí. Zdá se, že Klingoni mají něco za lubem - ale nehodlají říct co. Sisko si proto na velitelství vyžádá jako poradce nadporučíka Worfa, jediného Klingona ve Hvězdné flotile.
Klingoni pod záminkou obrany proti Dominionu provedli invazi do Cardassie. Rada Federace agresi odmítla a Klingoni proto ukončili všechny mírové dohody s Federací. Válka mezi letitými spojenci je na spadnutí. Sisko s Defiantem spěchá na pomoc členům cardassijské civilní vlády; pokud se vládní činitelé dostanou do ruky Klingonům, budou popraveni.
04x08 Zelení mužíčci
Nog se chystá odcestovat na Zemi, kde má začít studovat na Akademii. Quark konečně získal vytouženou loď, kterou mu bratranec Gaila už deset let dlužil - a v náhlém záchvatu dobročinnosti navrhne, že si s Nogem a Romem (a skladem plným kontrabandu) udělají malý výlet na Zemi. Cestou dojde k nehodě; loď je katapultována do roku 1947 a ztroskotá kdesi poblíž městečka Roswell v Novém Mexiku.
04x09 Meč Kahlessův
Na stanici opět přichází slavný klingonský hrdina Kor. Tentokrát pátrá po legendárním Kahlessově bat'lethu, ukradeném před mnoha staletími cizinci zpoza červí díry. Worf a Jadzia mají Kora na výpravu do Gama kvadrantu doprovodit; Sisko doufá, že úspěch výpravy by mohl napravit pošramocené vztahy mezi Klingony a Federací.
04x10 Náš muž Bashir
Bashir si užívá každičkou volnou chvíli v simulátorovém programu, zasazeném do světa Jamese Bonda. Nešťastný doktor se právě snaží vyrovnat s tím, že se mu zvědavý Garak vetřel do jeho soukromého programu, když tu do virtuálního světa přibude skupina několika dalších problematických hostí a v simulátoru začne jít o život.
04x11 Na domácí frontě
Na diplomatické konferenci v Antverpách dojde k bombovému útoku, který si vyžádá životy sedmadvaceti delegátů. Útok je vzápětí odhalen jako práce Měňavců - což znamená, že samotné srdce Federace již bylo infiltrováno dominionskými podvrženci. Sisko a Odo se na žádost admirála Leytona vydávají na Zemi, aby poskytli své cenné zkušenosti v odhalování podvrženců a boji proti nim.
04x12 Ztracený ráj
Sabotáž Měnavců ochromí energetickou síť celé Země, což dá Siskovi a admirálu Leytonovi do ruky dostatečný argument, aby dokázali přesvědčit pacifistického presidenta Jaresh-Inyo k vyhlášení vyjímečného stavu. Životy obyvatel Země zasáhne všudypřítomná paranoia, občanské svobody jsou bezprecedentně omezeny - a Sisko začíná pochybovat o správnosti užitých postupů.
04x13 Objekt zájmu
Dávný Kiřin přítel Shakaar Edon - někdejší farmář a bojovník za svobodu, nynější premiér bajorské vlády - přichází na DS9, aby se zástupci Federace jednal o přistoupení Bajoru k Federaci. Odo, pověřený péčí o premiérovu bezpečnost, znepokojeně sleduje narůstající milostné jiskření mezi Kirou a Shakaarem.
04x14 Návrat na výsluní
Kira dostane od Shakaara důležitý úkol: má navštívit cardassianskou základnu a v rámci vzájemné spolupráce předat Cardassianům materiály o Klingonech, získané bajorskou tajnou službou. Kira na setkání cestuje nákladní lodí, které velí degradovaný gul Dukat. Po příletu na místo se ukáže, že základna byla zničena Klingony; Dukat v tom vidí jedinečnou možnost, jak si získat zásluhy a vydobýt zpět své někdejší vysoké postavení.
04x15 Synové Moghovi
Na stanici přibyl Worfův bratr Kurn. Je velmi špatně naladěn a má k tomu dobrý důvod: poté, co se Worf v nedávném sporu vzepřel kancléři Gowronovi a postavil se na stranu Federace, byl Moghův rod zbaven cti a Kurn byl vyloučen z Vysoké rady. Přišel tedy svého bratra požádat, aby na něm provedl Mauk-to'Vor - rituální usmrcení válečníka, který už nemá pro co žít.
04x16 Kolektivní vyjednávání
Quark je vzorný ferengský zaměstnavatel, který se svými zaměstnanci zachází zcela v souladu s ferengským pracovním právem. To znamená žádné prémie, žádné placené volno, žádné nemocenské. Rom kvůli tomu málem přijde o život. Když se pak Quark rozhodne snížit všem zaměstnancům plat, rozhořčený Rom za vydatného ponoukání Bashira a O'Briena založí odbory a vyrazí do třídního boje proti vykořisťovatelskému bratru.
04x17 Vyslancův návrat
Z červí díry se vynoří tři sta let stará bajorská solární plachetnice a na její palubě je nalezen postarší Bajoran Akorem Laan, který tvrdí, že je Vyslancem. Sisko mu tuze rád svou náboženskou úlohu přenechá.
Akorem Laan však začne na Bajoru zavádět dávno překonané staré zvyklosti, které budou překážkou přistoupení Bajoru k Federaci. Sisko začíná pochybovat o správnosti svého rozhodnutí.
04x18 Unáhlené rozhodnutí
Worf s Defiantem doprovázel konvoj cardassiasnských nákladních lodí, převážející humanitární pomoc na jednu z jejich kolonií. Konvoj byl přepaden Klingony a Worf v zápalu boje zničil maskovanou klingonskou loď - dopravní loď, na jejíž palubě cestovalo 441 civilistů. Klingonská říše žádá vydání Worfa, aby mohl být souzen podle klingonských zákonů.
04x19 Těžké časy
O'Brien byl při návštěvě planety Argratha obviněn ze špionáže a strávil dvě desítky virtuálních let v neexistujícím vězení. Pro jeho rodinu a přátele uplynulo jen několik dní, zatímco Miles už prakticky zapomněl, že kdy vedl normální život.
04x20 Roztříštěné zrcadlo
Siska navštíví Jennifer ze zrcadlového vesmíru, aby mu oznámila, že vzbouřencům se podařilo obsadit Terok Nor. Když se s Jennifer setká Jake, je naprosto okouzlen a ochotně se s ní vydá na návštěvu jejího světa. Právě v to Jennifer doufala: prostřednictvím Jakea chce přilákat Siska do zrcadlového vesmíru a přimět ho, aby pomohl vzbouřencům zprovoznit jejich verzi Defiantu.
04x21 Dotek múzy
Odo se musí postarat o těhotnou Lwaxanu Troi. Ta uprchla před svým tavnianským manželem, který jí chce v duchu tavnianského pravidla ženy mají vychovávat ženy, muže mají vychovávat muži zabavit ještě nenarozeného syna.
Jake Sisko se zatím seznámí se svůdnou cizinkou jménem Onaya, která jeví poněkud nezdravý zájem o jeho literární tvorbu.